介绍

PSISearch2D 运行查询种子迭代序列搜索以进行远程相关蛋白质检索。它检索 Pfam 和 UniProtKB 结构域注释以获取结果，并在新颖的可视化中演示结构域和序列比对的组合。新定义了一个称为 C 值的评分模型，以在考虑序列和域对齐的组合的情况下重新排序命中。PSISearch2D 提高了预测性能，并能够在远程蛋白质检测中表征未知蛋白质。结合自动迭代模式的高级功能来处理大规模数据和全局和局部序列比对的可选程序，PSISearch2D 增强了远程相关的蛋白质搜索。

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发表的文献

Yang,M., Zhang,W., Yao,G. et al. Combined alignments of sequences and domains characterize unknown proteins with remotely related protein search PSISearch2D.Database (2019) Vol. 2019: article ID baz092;