ncRPheno 是一个综合数据库,它提供了11个物种(智人, 小鼠, 褐家鼠, 恒河猴, 野猪, 普通绒, 家鸡, 家犬, 黑猩猩, 斑马鱼 和 穴兔)的非编码RNA(ncRNAs,包括miRNA、lncRNA、circRNA、snoRNA和piRNA等)和疾病表型之间基于实验的关联数据。ncRNAs已被实证实为一类新的用于疾病诊断、治疗和预后的生物标志物和潜在药物靶点,因而它与疾病表型之间关系的发现也变得越发重要。ncRPheno通过对来自大约20个人工管理的数据库的关联数据进行均一化整合,提供了ncRNA与疾病表型之间经实验验证的关联数据。此外,ncRPhone还提供了用户友好的web界面和便捷的应用程序编程接口,使用者们可自主浏览、搜索、排列、分析和访问数据。引自ncRPheno: Wenliang Zhang et al. (2020), ncRPheno: a comprehensive database platform for identification and validation of disease related noncoding RNAs, RNA Biology, DOI:10.1080/15476286.2020.1737441
lncRNA | miRNA | circRNA | snoRNA | piRNA | |
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482751 | 202616 | 263012 | 15257 | 1282 | 584 |
智人 | 小鼠 | 褐家鼠 | 恒河猴 | 野猪 | 黑猩猩 | 普通绒 | 家鸡 | 家犬 | 斑马鱼 | 穴兔 | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
482751 | 416904 | 47318 | 16006 | 739 | 715 | 654 | 180 | 150 | 45 | 28 | 12 |
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